বারো ভূঁইয়া মধ্যযুগের শেষের দিকে এবং আধুনিক যুগের গোড়ার দিকে বাংলার সৈনিক-ভূস্বামীদের জোটকে বোঝায়। এই জোটের নেতৃত্বে ছিলেন ইশা খাঁ ও তার পুত্র মুসা খাঁ। বারো ভূঁইয়ারা বাংলার সুলতানি আমলে স্বাধীন রাজা হিসেবে রাজত্ব করতেন। কিন্তু ১৫৭৫ সালে সম্রাট আকবর বাংলা দখল করার পর এসকল জমিদার ঐক্যবদ্ধ হয়ে মোগল সৈন্যের বিরুদ্ধে যুদ্ধ করেন।
বারো ভূঁইয়ার মধ্যে উল্লেখযোগ্যরা হলেন:
- প্রতাপাদিত্য – যশোর বা চ্যাণ্ডিকান
- চাঁদ রায় ও কেদার রায় – শ্রীপুর বা বিক্রমপুর,
- রাজা রাজবল্লভ সেন,কন্দর্প রায় ও রামচন্দ্ররায় – বাকলা বা চন্দ্রদ্বীপ[৪]
- কিঙ্কর সেন – পিরোজপুর
- লক্ষ্মণমাণিক্য – ভুলুয়া,
- মুকুন্দরাম রায় ও সত্রাজিৎ রায়, ভূষণা বা ফতেহাবাদ – ফরিদপুর
- বীর হাম্বির – বিষ্ণুপুর
- ঈশা খাঁ – সোনারগাঁও
- ফজল গাজী – ভাওয়াল ও চাঁদপ্রতাপ,
- কংসনারায়ন রায় – তাহিরপুর,
- রাজা রামকৃষ্ণ – সাতৈর বা সান্তোল,
- পীতম্বর ও নীলাম্বর সেন – পুঁটিয়া, এবং রঙ্গপুর
- ঈশা খাঁ লোহানী ও উসমান খাঁ লোহানীঃ – উড়িষ্যা ও হিজলী।
- রশ্নি খা
বারো ভূঁইয়াদের যুদ্ধ মোগলদের জন্য একটি চ্যালেঞ্জ ছিল। তারা মোগলদের বিরুদ্ধে বেশ কয়েকটি যুদ্ধে জয়লাভ করেন। কিন্তু শেষ পর্যন্ত তারা মোগলদের কাছে পরাজিত হন।
বারো ভূঁইয়াদের যুদ্ধ বাংলার ইতিহাসে একটি গুরুত্বপূর্ণ ঘটনা। এই যুদ্ধের ফলে বাংলায় মোগলদের শাসনের ভিত্তি দৃঢ় হয়।
